沈阳海关座落于辽宁省省会沈阳，是直属于海关总署的正厅级海关，辖区覆盖了沈阳、抚顺、锦州、阜新、辽阳、铁岭、朝阳、葫芦岛等8个城市。
1840年鸦片战争后，中国被迫与外国列强签订了1000多个不平等的条约。根据1903年和1904年日本、美国强迫清政府签订的《通商行船续订条约》、《会谈东三省事宜正约》和《附约》，奉天府（沈阳）由中国政府自行开埠。1906年英籍税务司欧礼斐到沈阳料理开埠。1907年2月，奉天关开设，欧礼斐任首任税务司。
从1906年筹办奉天关起，到1932年，奉天关共有20位行政领导，分别来自英国、挪威、意大利、日本和法国。
1931年，日本发动了“9.18”事变，由于国民党政府的消极抵抗，致使东北全部沦陷。1932年9月，财政部发布了东三省海关移设关内办公布告，东北所有海关关闭，关税暂由国内别处海关征收。
1932年，伪满财政部宣布将“满洲国”版图内全部海关改制为伪满税关，奉天关同时改为奉天税关。
1945年8月，日本宣布无条件投降。
1946年，国民党政府海关总税务司署批准成立沈阳关及长春、锦县支关。一九四七年一月，沈阳关正式成立。
1948年，东北解放在即，10月沈阳关税务司刘贻禄携档案、公物撤至天津关，沈阳关宣布关闭。
1948年11月2日，沈阳解放，沈阳关从此结束了长达40余年的屈辱历史，重获新生。在沈阳解放初期，沈阳地区的海关业务由东北税务总局税政处关税科负责办理。
1949年9月16日，东北海关管理局在沈阳正式成立，统一管理东北地区的海关机构和业务，同时具体承办沈阳地区的货运监管、征收关税、查缉走私等。
1953年2月27日，东北海关管理局奉令撤消，中华人民共和国沈阳关成立，由中央人民政府海关总署和外贸部东北特派办双重领导。经过了新中国成立后近30年的努力探索，伴随着改革开放的全面深入，沈阳海关的职能也日趋完善，将在促进地方外向型经济发展中发挥更加突出的作用。
1980年2月，国务院颁布《关于改革海关管理体制的决定》。同年，沈阳关正式更名为中华人民共和国沈阳海关。其后，历经几次机构变迁，2002年升格为正厅级直属海关。
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